宫颈囊肿的形成原因与脸上的“青春痘”相似，是在宫颈炎愈合过程中，新生的鳞状上皮覆盖宫颈腺管口或仲入腺管，将腺管口阻塞；腺管周围的结缔组织增生或瘢痕形成压迫腺管，使腺管变窄甚至阻塞，腺体分泌物引流受阻，滞留形成的囊肿。
而宫颈囊肿也可以称之为宫颈纳氏囊肿，表现在宫颈上，以宫颈口和宫颈管更为常见，常常表现为大小不一的囊泡，囊泡颜色为青白色，有的女性如果有充血的话，那么，囊泡可以表现为粉红色或是鲜红色，以及有内含粘液的现象。
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